将美国药典中纯化水与注射用水的水质标准作一比较，就可看出二者的主要区别。它们的理化指标相同，但注射用水对热原及微生物的要求高于纯化水。
项　目：纯化水 微生物：<100CFU/mL 热原：不指定　生产方法：蒸馏 离子交换 反渗透 其他适当的方法

项　目：注射用水　微生物：10CFU/100mL　热原：<0.25EU/mL 生产方法：蒸馏 反渗透

　　纯化水与注射用水二者的区别还在于制水工艺，纯化水的制备工艺可以有各种选择，但各国药典对注射用水的制备工艺均有限定条件，如美国药典明确规定注射用水的制备工艺只能是蒸馏及反渗透，中国药典则规定注射用水的生产工艺必须是蒸馏。这些是各国根据本国的实际情况用以保证注射用水质量的必要条件。